Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms