Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab17P35292 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms