Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif5cP28738 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms