Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms