Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim30aP15533 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms