Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms