Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtaP09225 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LtaP09225 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtaP09225 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtaP09225 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtaP09225 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtaP09225 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LtaP09225 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LtaP09225 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtaP09225 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtaP09225 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtaP09225 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtaP09225 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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