Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms