Protein–RNA interactions for Protein: O55060

Tpmt, Thiopurine S-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpmtO55060 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpmtO55060 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TpmtO55060 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpmtO55060 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms