Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SlkO54988 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SlkO54988 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SlkO54988 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SlkO54988 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SlkO54988 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SlkO54988 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SlkO54988 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SlkO54988 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SlkO54988 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SlkO54988 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SlkO54988 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SlkO54988 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SlkO54988 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SlkO54988 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SlkO54988 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SlkO54988 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SlkO54988 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SlkO54988 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms