Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pole2O54956 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms