Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3cO35066 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3cO35066 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms