Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClockO08785 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClockO08785 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClockO08785 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClockO08785 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClockO08785 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClockO08785 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms