Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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