Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm379J3QQ19 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm379J3QQ19 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm379J3QQ19 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm379J3QQ19 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm379J3QQ19 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm379J3QQ19 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm379J3QQ19 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Gm379J3QQ19 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm379J3QQ19 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm379J3QQ19 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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