Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cphx3-201ENSMUST00000163305 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms