Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms