Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20509G3UZF1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20509G3UZF1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20509G3UZF1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20509G3UZF1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20509G3UZF1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms