Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms