Protein–RNA interactions for Protein: F6ZDS4

Tpr, Nucleoprotein TPR, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprF6ZDS4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TprF6ZDS4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms