Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm20518E9Q548 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm20518E9Q548 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm20518E9Q548 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm20518E9Q548 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm20518E9Q548 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm20518E9Q548 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm20518E9Q548 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm20518E9Q548 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm20518E9Q548 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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