Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms