Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3250E9Q1M3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms