Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms