Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms