Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms