Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms