Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms