Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms