Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cped1B2RX70 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms