Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms