Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cldn34b1B1AZQ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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