Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin4A2AMM0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin4A2AMM0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin4A2AMM0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin4A2AMM0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin4A2AMM0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin4A2AMM0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin4A2AMM0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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