Protein–RNA interactions for Protein: A2AD83

Frmd7, FERM domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd7A2AD83 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Frmd7A2AD83 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Frmd7A2AD83 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Frmd7A2AD83 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Frmd7A2AD83 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Frmd7A2AD83 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Frmd7A2AD83 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Frmd7A2AD83 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Frmd7A2AD83 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Frmd7A2AD83 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms