Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms