Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms