Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms