Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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RAB39AQ14964 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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RAB39AQ14964 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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RAB39AQ14964 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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RAB39AQ14964 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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RAB39AQ14964 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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RAB39AQ14964 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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