Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms