Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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