Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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