Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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TRIM35Q9UPQ4 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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TRIM35Q9UPQ4 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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TRIM35Q9UPQ4 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 OVCH1-201ENST00000318184 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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TRIM35Q9UPQ4 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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TRIM35Q9UPQ4 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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TRIM35Q9UPQ4 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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TRIM35Q9UPQ4 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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TRIM35Q9UPQ4 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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