Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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