Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms