Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms