Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
GDAP2Q9NXN4 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GDAP2Q9NXN4 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms