Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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SGF29Q96ES7 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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SGF29Q96ES7 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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SGF29Q96ES7 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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SGF29Q96ES7 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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