Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RAB6CQ53S08 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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RAB6CQ53S08 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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RAB6CQ53S08 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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RAB6CQ53S08 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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RAB6CQ53S08 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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RAB6CQ53S08 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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RAB6CQ53S08 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB6CQ53S08 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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