Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms