Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms